大厄災と呼ばれる災害が起こり ハイラル王国は滅亡した…。
ハイラル王国は遙か昔、神話の時代から、何度も何度も魔王ガノンの厄災に見舞われてきた。
その度に退魔の力を持つ騎士と、聖なる力を持つ姫によって封印されてきた。
1万年前、高度な技術文明を確立していたハイラル王国は、その技術を以てガノン封印の一助とすべく4体の巨大兵器「神獣」と自律無人兵器「ガーディアン」たちを製造し、退魔の騎士と姫の聖なる力でガノンを封印した。
それから100年後、リンクは永い眠りから目覚め、不思議な声に導かれて大地へと踏み出す。